與DNA檢測不同，mRNA檢測并非分析基因序列，而是檢測基因要產生「蛋白質」前中間產物- mRNA的產量。當細胞在活動時，基因就會具有高度活性，為了要產生足夠的蛋白質「做工」，所以mRNA的產量也會上升，藉由偵測與疾病相關的mRNA分子標記的產量，就可評估身體目前的狀況，如是否罹病、疾病目前狀態、治療狀況等等。